Володимир Юрійович народився 8 лютого 1979 року на Харківщині.

У віці шести років разом із родиною переїхав в с. Жадківка. Навчався в початковій Жадківській школі, а згодом у Корецькій ЗШ №3.

В 1985 році переїхав у місто Нетішин де і закінчив школу. Опісля вступив до Рівненського інституту водного господарства на спеціальність "економіка"

.У 2001 році Володимир Нікітенко закінчив Рівненський державний технічний університет та військову кафедру за фахом «Інженерна розвідка». 

В липні 2022 року Володимир Нікітенко був призваний на військову службу по мобілізації до 3 прикордонного загону Державної прикордонної служби України та був призначений у відділ прикордонної служби «Троїцьке», де в подальшому під час ротації підрозділу в Мукачівському прикордонному загоні в період з 10 липня 2022 року по 20 січня 2023 року проходив службу у відділенні інспекторів прикордонної служби «Солотвино» та у відділі прикордонної служби «Яблунівка».

З січня по квітень 2023 року майор Володимир Нікітенко у складі четвертого відділу прикордонної служби мужньо та героїчно виконував бойові завдання з оборони н.п. Райгородка Луганської області, н.п. Першотравневе Харківської області від російських загарбників. Очолював взводний опорний пункт № 29.

Під постійними ворожими мінометними обстрілами він неодноразово особисто брав участь у відбитті збройних атак ворога на позиції прикордонників, чим проявив героїзм та відвагу. Попри чисельну перевагу окупантів, Володимир Нікітенко мужньо виконував усі поставлені перед ним бойові завдання. Зокрема, у взаємодії з військовослужбовцями 3 полку Сил спеціальних операції неодноразово здійснював виходи у «сіру зону» з подальшим мінуванням можливих шляхів підходу ворожих диверсійно-розвідувальних груп. У тісній взаємодії з військовослужбовцями Збройних Сил України брав безпосередню участь у відбитті п’яти спроб заходу на ввірені йому позиції ворожих диверсійно-розвідувальних груп противника в складі не менше 10 осіб. Він особисто здійснював керівництво боєм та коригував вогонь АГС-17 та СП-9, завдавши ворогу значних втрат у живій силі. Своїми самовідданими діями майор Володимир Нікітенко проявив лідерські якості та вчергове підтвердив свою вірність рідній державі, надихаючи побратимів власним прикладом.

З 11 січня 2024 року військовослужбовець виконував завдання на Бахмутському напрямку в районі н.п. Курдюмівка Бахмутського району Донецької області в складі третього відділу прикордонної служби другої прикордонної комендатури швидкого реагування, Володимир Нікітенко здійснював керівництво взводним опорним пунктом «Коршун» й організовував взаємодію між побратимами. 

Під його керівництвом прикордонники, попри нищівні обстріли ворога, здійснювали оборону позиції. Він організував взаємодію між сусідніми вогневими позиціями, завдяки чому зросла обороноздатність позицій прикордонників й навіть із залученням БпЛА відбулося відбиття штурму ворогом позиції «Чайка». 

29 січня 2024 року під час чергового ворожого обстрілу вогневої позиції в районі н.п. Курдюмівка, де перебував майор Володимир Нікітенко, він отримав осколкові поранення несумісні з життям.

За особисту мужність і самовіддані дії, виявлені у захисті державного суверенітету та територіальної цілісності України, вірність військовій присязі майор Нікітенко Володимир Юрійович нагороджений орденом «За мужність» ІІІ ступеня (посмертно).