З 2019 року штаб-сержант Богдан Моргун проходив військову службу в 9 прикордонному загоні Державної прикордонної служби України. З початку проходив військову службу в підрозділах охорони кордону, а з лютого 2023 року – в складі прикордонної комендатури швидкого реагування.

З квітня по липень 2023 року гідно виконував бойові завдання в Харківській та Луганській областях, приймаючи активну участь у відбитті збройної агресії російської федерації в зоні відповідальності оперативно-тактичного угрупування «Донецьк», а саме на Авдіївському напрямку. Під час виконання бойових завдань у складі розрахунку протитанкового засобу прикордонник разом зі своїми побратимами знищив декілька одиниць бронетехніки та живу силу противника.

З 16 травня 2024 року виконував бойові завдання із захисту територіальної цілісності нашої Батьківщини в Харківській області в складі Сил оборони України. Військовослужбовець був прикладом для своїх побратимів.

01 червня 2024 року штаб-сержант Богдан Моргун спільно з побратимами прямував на вогневу позицію «Кент» в районі н.п. Бочкове Харківської області, знаходячись безпосередньо біля противника. Під час слідування на позицію відбувся підрив на мінно-вибуховому пристрої, внаслідок чого штаб-сержант Богдан Моргун отримав поранення несумісні з життям та загинув на місці.

За особисту мужність і самовіддані дії, виявлені у захисті державного суверенітету та територіальної цілісності України, вірність військовій присязі штаб-сержант Моргун Богдан Олександрович нагороджений медаллю «За військову службу Україні» (посмертно).