У 2019 році головний сержант Роман Чоботок уклав контракт з Державною прикордонною службою України та проходив військову службу в 5 прикордонному загоні – Сумська область. За цей час зарекомендував себе відданим українському народові, військовому обов’язку та справі охорони державного кордону. 

З початком повномасштабного вторгнення російської федерації на територію України, разом з побратимами мужньо протистояв ворогу. Спільними зусиллями, в складі прикордонного підрозділу, працював над облаштуванням фортифікаційних споруд, що в подальшому підвищить бойові можливості прикордонної застави в оборонному бою. 

Військовослужбовець неодноразово вступав у зіткнення з важкою технікою противника, потрапляв під авіаційні та щільні мінометні, артилерійські обстріли, з території російської федерації.

Адекватно реагував на виникнення кризових, нестандартних та раптово виникаючих ситуацій, щодо стримування агресії з боку ворога. Вмів визначати напрямок у забезпеченні оптимального рівня бойової готовності, проявляв здібності у виконанні поставлених завдань.

Спільно з військовослужбовцями Збройних Сил України ніс чергування на контрольних постах та забезпечував підтримання правопорядку в районі н.п. Краснопілля Сумської області.

У 2023 році головний сержант Роман Чоботок пройшов курс підготовки снайперів на базі Головного центру підготовки особового складу Державної прикордонної служби України імені генерал-майора Ігоря Момота.

06 жовтня 2023 року під час руху на автотранспорті до місця несення служби в районі н.п. Новодмитрівка Сумської області, військовослужбовці зі складу прикордонного наряду, в якому перебував Роман Чоботок, потрапили в засідку диверсійно-розвідувальної групи противника. В ході бойового зіткнення з ворожою силою, головний сержант Роман Чоботок отримав поранення несумісні з життям.

За особисту мужність і самовіддані дії, виявлені у захисті державного суверенітету та територіальної цілісності України, вірність військовій присязі головний сержант Чоботок Роман Миколайович нагороджений медаллю «Захиснику Вітчизни» (посмертно).